Como corrigir automaticamente permissões inseguras em scripts e pastas de um domínio no linux/whm?

Rode os comandos como root:

find /home/*/public_html -type d -exec chmod 755 {} \;
find /home/*/public_html -type f -exec chmod 644 {} \;

Isto fará com que os arquivos possam receber permissões 644 e os diretórios 755.

Abraços.